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Iso-Seq トライアルキャンペーン


さまざまな生物で遺伝子の全長配列決定を行う Iso-Seq(Isoform Sequencing)のご案内です。

サービス概要

 
 

Iso-Seq のご利用例

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解析原理

発現解析のリファレンスに
Iso-Seq でリファレンス配列を構築し、イルミナデータを用いて発現解析を行いました。
Iso-Seq では、mRNA を断片化せずにライブラリ化し、PacBio SMRT cell の小孔で1分子の cDNA を繰り返しシーケンスします。
繰り返し読まれたリードのコンセンサス配列が、アイソフォームの全長配列となります。

対象生物

498,000 円 / 検体(税別)
 
 

ご用意いただくサンプル

2021年 730(金)まで
※ ご依頼が多い場合は、期限前に締め切らせていただくことがございます。
 
 

解析仕様

◎ サンプル品質検査通過後、約3か月
※ 乗り合いサンプルの集まり状況により、納期が前後する場合がございます。
     予めご了承ください。
 
 
ロングリードシーケンサーを使用して、遺伝子の全長配列を網羅的に決定します。
Sequel Ⅱ の乗り合い解析サービス開始にあたり、期間限定のトライアルキャンペーンを実施いたします。
トランスクリプトームデータ作成
ゲノムの読まれていない生物で、Iso-Seq により完全長 cDNA 配列のデータベースを作成しました。
遺伝子の全長配列取得
N末端アミノ酸配列分析で取得した断片配列から、Iso-Seq で全長配列を決定しました。
ホモログ遺伝子探索
Iso-Seq により網羅的な遺伝子配列情報を取得し、既知遺伝子と相同な遺伝子を探索しました。
※ 遺伝子発現量の算出には、別途イルミナデータが必要となります。
真核生物
※ poly (A) RNA が解析対象となります。
精製済み Total RNA 12μg以上(濃度:300ng / μL以上、液量:40μL 以上)
※ RNAは、Nuclease Free Water に溶解してください。
※ サンプル量が上記基準に満たない場合でも、解析可能な場合がございますのでご相談ください。
[ RNA を抽出する組織について ]
網羅的な遺伝子配列データベースを作成したい場合には、組織ごとの発現を均衡化するために、様々な組織の Total RNA をプールしたサンプルをご用意いただくことを推奨いたします。
特定の遺伝子配列探索を目的とする場合は、該当遺伝子が高発現している組織から RNA を抽出していただくことを推奨いたします。
・ライブラリ調製
・Seque Ⅱ 乗り合いシーケンスデータ取得 20Gb / 検体
・データ解析(トランスクリプト配列作成、アノテーション情報付与)
 
 

対象生物

 
 

サンプル受入期間

 
 

納期