解析プラン
次世代シーケンス解析 Illumina パッケージプラン
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北海道システム・サイエンス株式会社
〒001-0932 北海道札幌市北区新川西2条1丁目2-1
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品質検査 ＋ ライブラリ調製 ＋ シーケンス（Illuminaシーケンサー；リード長150bp, 読取方法ペアエンド）
サンプル必要量
| 提供サンプル種別 | 対応アプリケーション | 総量 | 濃度 | 液量 | サイズ | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ① | 精製済み Total RNA | ① 真核生物 RNA-Seq | ≧ 5 μg | ≧ 50 ng / μL | ≧ 40μL | － |
| ② 原核生物 RNA-Seq ⑫ メタトランスクリプトーム |
≧ 6 μg | ≧ 50 ng / μL | ≧ 40μL | － | ||
| ⑬ Small RNA-Seq | ≧ 6 μg | ≧ 100 ng / μL | ≧ 40μL | － | ||
| ② |
精製済みゲノムDNA
|
③-⑤ DNA-Seq
⑦ ヒトゲノム ⑧ ヒトエクソーム ⑪ メタゲノム |
≧ 5 μg
|
≧ 50 ng / μL
|
≧ 40μL | － |
|
⑨-⑩ バイサルファイト
|
≧ 6 μg
|
≧ 50 ng / μL
|
≧ 40μL | － | ||
| ③ |
精製済み ChIP-DNA
|
⑥ ChIP-Seq
|
≧ 100 ng
|
≧ 5 ng / μL
|
≧ 20μL | 100-500 bp |
オプションデータ解析
価格はすべて税別です
| アプリケーション | 解析プラン | 提供サンプル | オプション データ解析 |
|
|---|---|---|---|---|
| トランス クリプトーム |
真核生物トランスクリプトーム | 詳細はこちら① | ① Total RNA | 詳細はこちら |
| 原核生物トランスクリプトーム | 詳細はこちら② | ① Total RNA | ||
| 低分子RNAプロファイル | 詳細はこちら⑬ | ① Total RNA | ||
| ゲノム・ エクソーム |
微生物ゲノム | 詳細はこちら③ | ② ゲノムDNA | |
| 動植物ゲノム - 中サイズ - （ イネ、ショウジョウバエ、魚類等 ） |
詳細はこちら④ | ② ゲノムDNA | ||
| 動植物ゲノム - 大サイズ - （ マウス、ラット、ウシ等 ） |
詳細はこちら⑤ | ② ゲノムDNA | ||
| エピゲノム | ChIPシーケンス | 詳細はこちら⑥ | ③ ChIP-DNA | |
| バイサルファイトシーケンス | 詳細はこちら⑨⑩ | ② ゲノムDNA | ||
| ヒトゲノム | ホールゲノム ( WGS ) | 詳細はこちら⑦ | ② ゲノムDNA | |
| エクソーム ( WES) | 詳細はこちら⑧ | ② ゲノムDNA | ||
| アプリケーション | データ量 ( /検体 ) |
リード長 | RAWデータ納品 ※ 1検体の場合 |
|
|
①
|
真核生物 RNA-Seq
|
6Gb
|
150PE | ￥140,000 / 検体 |
| ② | 原核生物 RNA-seq | 2.4Gb | 150PE | ￥128,000 / 検体 |
| ③ | DNA-Seq | 6Gb | 150PE | ￥135,000 / 検体 |
|
④
|
DNA-Seq ( 動植物ゲノム - 中サイズ - )
|
45Gb
|
150PE | ￥269,000 / 検体 |
|
⑤
|
DNA-Seq ( 動植物ゲノム - 大サイズ - ) | 90Gb | 150PE | ￥344,000 / 検体 |
| ⑥ | ChIP-Seq | 6Gb | 150PE | ￥135,000 / 検体 |
|
⑦
|
ヒトゲノム
|
90Gb | 150PE | ￥308,000 / 検体 |
|
⑧
|
ヒトエクソーム
|
6Gb | 150PE | ￥148,000 / 検体 |
| ⑨ | ヒトゲノムバイサルファイトシーケンス | 90Gb | 150PE | ￥572,000 / 検体 |
| ⑩ |
動物・植物ゲノムバイサルファイトシーケンス
|
90Gb | 150PE | ￥668,000 / 検体 |
| ⑪ | メタゲノムシーケンス | 6Gb | 150PE | ￥107,000 / 検体 |
| ⑫ | メタトランスクリプトームシーケンス | 6Gb | 150PE | ￥157,000 / 検体 |
弊社バイオインフォマティクススタッフによる自社解析、安心のサポートとわかりやすいレポート（日本語）
提携先（国外）での解析。安価に結果を得ることができます。（英文レポートでの納品）
価格はすべて税別です
品質検査 ＋ ライブラリ調製 ＋ シーケンス（Illuminaシーケンサー；リード長50bp, 読取方法シングルリード）
| アプリケーション | データ量 ( /検体 ) |
リード長 | RAWデータ納品 ※ 1検体の場合 |
|
| ⑬ |
Small RNA-Seq
|
2000万リード | 50SE | ￥190,000 / 検体 |
価格はすべて税別です
アプリケーション選択
|
解析プラン
|
対応データ量 |
価格
|
|
| DNA-Seq 動植物ゲノム - 大サイズ - |
マッピング＋SNP/Indel 候補検索
|
3億リードペアまで | ￥75,000 / 検体 |
|
マッピング＋SNP/Indel 候補検索＋構造変異検索＋CNV
|
3億リードペアまで | ￥139,000 / 検体 | |
| ヒトゲノム |
マッピング＋SNP/Indel 候補検索＋構造変異検索＋CNV
|
3億リードペアまで | ￥47,000 / 検体 |
| ヒトエクソーム | マッピング＋SNP/Indel 候補検索＋アノテーション | 4000万リードペアまで | ￥29,000 / 検体 |
|
ヒトゲノム
バイサルファイト |
マッピング＋メチル化頻度解析＋GO解析＋KEGG解析
|
3億リードペアまで |
￥225,000 / 検体
|
|
動物・植物ゲノム
バイサルファイト |
マッピング＋メチル化頻度解析＋GO解析＋KEGG解析
|
3億リードペアまで |
￥332,000 / 検体
|
|
メタゲノム
|
アセンブル＋分類・機能アノテーション＋パスウェイ解析
|
2000万リードペアまで |
￥93,000 / 検体
|
|
メタトランス
クリプトーム |
アセンブル＋機能アノテーション＋発現量数値化 ＋GO解析＋パスウェイ解析 |
2000万リードペアまで | ￥100,000 / 検体 |
価格はすべて税別です
| 解析プラン | 対応データ量 | 価格 | |
|---|---|---|---|
| RNA-Seq | 遺伝子発現解析（ リファレンス配列のある生物 ） | ||
| ・遺伝子発現解析 | 2000万リードペアまで | ￥50,000 / 検体 | |
| ・有意差検定 | - | ￥50,000 / 解析 | |
| ・GO解析 | - | ￥70,000 / 解析 | |
| ・パスウェイ解析 | - | ￥70,000 / 解析 | |
| トランスクリプトーム配列決定解析 （Link） | |||
| ・アセンブル | 5000万リードペアまで | ￥100,000 / 解析 | |
| ＋マッピング＋発現頻度解析 | 2000万リードペアまで | ￥70,000 / 検体 | |
| ＋アノテーション情報付与 | 20万配列まで | ￥200,000 / 検体 | |
| DNA-Seq | 変異解析 （Link） | ||
| ・マッピング＋SNP/Indel 候補検索 | 2000万リードペアまで | ￥100,000 / 検体 | |
| ・マッピング＋SNP/Indel 候補検索＋構造変異検索 | 2000万リードペアまで | ￥200,000 / 検体 | |
| ゲノム配列決定解析 （Link） | |||
| ・アセンブル | 2000万リードペアまで | ￥100,000 / 検体 | |
| ＋真核生物アノテーション情報付与 | ｹﾞﾉﾑｻｲｽﾞ100Mbまで | ￥300,000 / 解析 | |
| ＋バクテリアゲノムアノテーション情報付与 | バクテリア限定 | ￥50,000 / 検体 | |
| Small RNA-Seq | 発現頻度解析（ ヒト・マウス ） | ||
| ・マッピング＋発現頻度解析（ 既知 miRNAのみ ） | 2000万リードペアまで | ￥80,000 / 検体 | |
| ＋2次構造予測（ 新規 miRNA候補検索 ） | - | ￥50,000 / 検体 | |
| 発現頻度解析（ その他の生物：参照ゲノム有 ） | |||
| ・マッピング＋発現頻度解析（ 既知 miRNAのみ ） | 2000万リードペアまで | ￥100,000 / 検体 | |
| ＋2次構造予測（ 新規 miRNA候補検索 ） | - | ￥50,000 / 検体 | |
| ChIP-Seq | 修飾ヒストンや転写因子の結合部位解析 （Link） | ||
| ・マッピング＋ピーク検出 | 2000万リードペアまで | ￥100,000 / 検体 | |
※ サンプル量が上記基準に満たない場合でも、解析可能な場合がございますので、事前にご相談ください。
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