解析プラン
次世代シーケンス解析 Illumina パッケージプラン
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北海道システム・サイエンス株式会社
〒001-0932 北海道札幌市北区新川西2条1丁目2-1
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品質検査 + ライブラリ調製 + シーケンス(Illuminaシーケンサー;リード長150bp, 読取方法ペアエンド)
サンプル必要量
提供サンプル種別 | 対応アプリケーション | 総量 | 濃度 | 液量 | サイズ | |
---|---|---|---|---|---|---|
① | 精製済み Total RNA | ① 真核生物 RNA-Seq | ≧ 5 μg | ≧ 50 ng / μL | ≧ 40μL | - |
② 原核生物 RNA-Seq ⑫ メタトランスクリプトーム |
≧ 6 μg | ≧ 50 ng / μL | ≧ 40μL | - | ||
⑬ Small RNA-Seq | ≧ 6 μg | ≧ 100 ng / μL | ≧ 40μL | - | ||
② |
精製済みゲノムDNA
|
③-⑤ DNA-Seq
⑦ ヒトゲノム ⑧ ヒトエクソーム ⑪ メタゲノム |
≧ 5 μg
|
≧ 50 ng / μL
|
≧ 40μL | - |
⑨-⑩ バイサルファイト
|
≧ 6 μg
|
≧ 50 ng / μL
|
≧ 40μL | - | ||
③ |
精製済み ChIP-DNA
|
⑥ ChIP-Seq
|
≧ 100 ng
|
≧ 5 ng / μL
|
≧ 20μL | 100-500 bp |
オプションデータ解析
価格はすべて税別です
アプリケーション | 解析プラン | 提供サンプル | オプション データ解析 |
|
---|---|---|---|---|
トランス クリプトーム |
真核生物トランスクリプトーム | 詳細はこちら① | ① Total RNA | 詳細はこちら |
原核生物トランスクリプトーム | 詳細はこちら② | ① Total RNA | ||
低分子RNAプロファイル | 詳細はこちら⑬ | ① Total RNA | ||
ゲノム・ エクソーム |
微生物ゲノム | 詳細はこちら③ | ② ゲノムDNA | |
動植物ゲノム - 中サイズ - ( イネ、ショウジョウバエ、魚類等 ) |
詳細はこちら④ | ② ゲノムDNA | ||
動植物ゲノム - 大サイズ - ( マウス、ラット、ウシ等 ) |
詳細はこちら⑤ | ② ゲノムDNA | ||
エピゲノム | ChIPシーケンス | 詳細はこちら⑥ | ③ ChIP-DNA | |
バイサルファイトシーケンス | 詳細はこちら⑨⑩ | ② ゲノムDNA | ||
ヒトゲノム | ホールゲノム ( WGS ) | 詳細はこちら⑦ | ② ゲノムDNA | |
エクソーム ( WES) | 詳細はこちら⑧ | ② ゲノムDNA |
アプリケーション | データ量 ( /検体 ) |
リード長 | RAWデータ納品 ※ 1検体の場合 |
|
①
|
真核生物 RNA-Seq
|
6Gb
|
150PE | ¥140,000 / 検体 |
② | 原核生物 RNA-seq | 2.4Gb | 150PE | ¥128,000 / 検体 |
③ | DNA-Seq | 6Gb | 150PE | ¥135,000 / 検体 |
④
|
DNA-Seq ( 動植物ゲノム - 中サイズ - )
|
45Gb
|
150PE | ¥269,000 / 検体 |
⑤
|
DNA-Seq ( 動植物ゲノム - 大サイズ - ) | 90Gb | 150PE | ¥344,000 / 検体 |
⑥ | ChIP-Seq | 6Gb | 150PE | ¥135,000 / 検体 |
⑦
|
ヒトゲノム
|
90Gb | 150PE | ¥308,000 / 検体 |
⑧
|
ヒトエクソーム
|
6Gb | 150PE | ¥148,000 / 検体 |
⑨ | ヒトゲノムバイサルファイトシーケンス | 90Gb | 150PE | ¥572,000 / 検体 |
⑩ |
動物・植物ゲノムバイサルファイトシーケンス
|
90Gb | 150PE | ¥668,000 / 検体 |
⑪ | メタゲノムシーケンス | 6Gb | 150PE | ¥107,000 / 検体 |
⑫ | メタトランスクリプトームシーケンス | 6Gb | 150PE | ¥157,000 / 検体 |
弊社バイオインフォマティクススタッフによる自社解析、安心のサポートとわかりやすいレポート(日本語)
提携先(国外)での解析。安価に結果を得ることができます。(英文レポートでの納品)
価格はすべて税別です
品質検査 + ライブラリ調製 + シーケンス(Illuminaシーケンサー;リード長50bp, 読取方法シングルリード)
アプリケーション | データ量 ( /検体 ) |
リード長 | RAWデータ納品 ※ 1検体の場合 |
|
⑬ |
Small RNA-Seq
|
2000万リード | 50SE | ¥190,000 / 検体 |
価格はすべて税別です
アプリケーション選択
解析プラン
|
対応データ量 |
価格
|
|
DNA-Seq 動植物ゲノム - 大サイズ - |
マッピング+SNP/Indel 候補検索
|
3億リードペアまで | ¥75,000 / 検体 |
マッピング+SNP/Indel 候補検索+構造変異検索+CNV
|
3億リードペアまで | ¥139,000 / 検体 | |
ヒトゲノム |
マッピング+SNP/Indel 候補検索+構造変異検索+CNV
|
3億リードペアまで | ¥47,000 / 検体 |
ヒトエクソーム | マッピング+SNP/Indel 候補検索+アノテーション | 4000万リードペアまで | ¥29,000 / 検体 |
ヒトゲノム
バイサルファイト |
マッピング+メチル化頻度解析+GO解析+KEGG解析
|
3億リードペアまで |
¥225,000 / 検体
|
動物・植物ゲノム
バイサルファイト |
マッピング+メチル化頻度解析+GO解析+KEGG解析
|
3億リードペアまで |
¥332,000 / 検体
|
メタゲノム
|
アセンブル+分類・機能アノテーション+パスウェイ解析
|
2000万リードペアまで |
¥93,000 / 検体
|
メタトランス
クリプトーム |
アセンブル+機能アノテーション+発現量数値化 +GO解析+パスウェイ解析 |
2000万リードペアまで | ¥100,000 / 検体 |
価格はすべて税別です
解析プラン | 対応データ量 | 価格 | |
---|---|---|---|
RNA-Seq | 遺伝子発現解析( リファレンス配列のある生物 ) | ||
・遺伝子発現解析 | 2000万リードペアまで | ¥50,000 / 検体 | |
・有意差検定 | - | ¥50,000 / 解析 | |
・GO解析 | - | ¥70,000 / 解析 | |
・パスウェイ解析 | - | ¥70,000 / 解析 | |
トランスクリプトーム配列決定解析 (Link) | |||
・アセンブル | 5000万リードペアまで | ¥100,000 / 解析 | |
+マッピング+発現頻度解析 | 2000万リードペアまで | ¥70,000 / 検体 | |
+アノテーション情報付与 | 20万配列まで | ¥200,000 / 検体 | |
DNA-Seq | 変異解析 (Link) | ||
・マッピング+SNP/Indel 候補検索 | 2000万リードペアまで | ¥100,000 / 検体 | |
・マッピング+SNP/Indel 候補検索+構造変異検索 | 2000万リードペアまで | ¥200,000 / 検体 | |
ゲノム配列決定解析 (Link) | |||
・アセンブル | 2000万リードペアまで | ¥100,000 / 検体 | |
+真核生物アノテーション情報付与 | ゲノムサイズ100Mbまで | ¥300,000 / 解析 | |
+バクテリアゲノムアノテーション情報付与 | バクテリア限定 | ¥50,000 / 検体 | |
Small RNA-Seq | 発現頻度解析( ヒト・マウス ) | ||
・マッピング+発現頻度解析( 既知 miRNAのみ ) | 2000万リードペアまで | ¥80,000 / 検体 | |
+2次構造予測( 新規 miRNA候補検索 ) | - | ¥50,000 / 検体 | |
発現頻度解析( その他の生物:参照ゲノム有 ) | |||
・マッピング+発現頻度解析( 既知 miRNAのみ ) | 2000万リードペアまで | ¥100,000 / 検体 | |
+2次構造予測( 新規 miRNA候補検索 ) | - | ¥50,000 / 検体 | |
ChIP-Seq | 修飾ヒストンや転写因子の結合部位解析 (Link) | ||
・マッピング+ピーク検出 | 2000万リードペアまで | ¥100,000 / 検体 |
※ サンプル量が上記基準に満たない場合でも、解析可能な場合がございますので、事前にご相談ください。
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